| dc.contributor.author | Pösö, Liisa | |
| dc.date.accessioned | 2022-07-01T21:01:54Z | |
| dc.date.available | 2022-07-01T21:01:54Z | |
| dc.date.issued | 2022-06-30 | |
| dc.identifier.uri | https://www.utupub.fi/handle/10024/154526 | |
| dc.description.abstract | Integriinit α1β1 ja α2β1 ovat solukalvolla sijaitsevia kollageenireseptoreita, jotka vaikuttavat merkittävästi useisiin eri solufunktioihin, kuten verihiutaleiden kiinnittymiseen, mesenkymaalisten kantasolujen lisääntymiseen ja kunnollisen immuunivasteen muodostumiseen. Integriinien αI-domeeni on integriinin ligandia sitova domeeni, joka muodostaa suoran kontaktin integriinin ja sen ligandin, tässä tapauksessa kollageenin, välille. Ligandin sitoutuessa αI-domeenin suljettu konformaatio muuttuu avonaiseksi ja ligandi muodostaa suoran kontaktin sitoutumiskohdan metalli-ionin kanssa. Suljetun ja avonaisen konformaation lisäksi α1β1-integriinillä tiedetään olevan kolmas välimuotokonformaatio, mutta vastaavaa rakennetta ei olla todettu α2β1- integriinille.
αI-domeenien konformaatiomuutoksen suljetusta muodosta avonaiseen aktiiviseen konformaatioon mahdollistaa αC-heliksissä olevan arginiinin ja α7-heliksissä olevan glutamaatin välinen ionisidos. Näiden aminohappojen rooleja αI-domeenin konformaatiomuutoksessa ja proteiinin aktiivisuudessa on tutkittu Arg/Ala- ja Glu/Ala-pistemutaatioilla.
Tämän Pro Gradu –tutkimuksen tavoitteena on tutkia ja verrata α1I- ja α2I-domeenien αC-heliksissä olevan arginiinin roolia αI-domeenin aktivaatiossa. α1I- ja α2I- domeenien sitoutumistehokkuutta tyypin I ja IV kollageeniin mitataan kollageenilla päällystettyjen kuoppalevyille tehtyjen sitoutumiskokeilla. Mittausten avulla selvitetään α1I- ja α2I-domeenien pistemutaatioiden vaikutusta αI-domeenien sitoutumistehokkuuteen. Sitoutumiskokeiden lisäksi arginiinin pistemutaation sisältävä α2I-domeeni kiteytettiin ilman ligandia paljastamaan mahdollisen aktivoidun α2I-domeenin rakenteen ja transitionaalisen konformaation.
Sitoutumiskokeiden tulosten perusteella α1β1 ja α2β1 integriinien aktivaatiomekanismeilla vaikuttaa olevan mekanistinen ero. Kiteytetyn α2I-domeenin rakenteen alustava analyysi ei kuitenkaan paljastanut selvää välimuotokonformaatiota. | |
| dc.format.extent | 68 | |
| dc.language.iso | fin | |
| dc.rights | fi=Julkaisu on tekijänoikeussäännösten alainen. Teosta voi lukea ja tulostaa henkilökohtaista käyttöä varten. Käyttö kaupallisiin tarkoituksiin on kielletty.|en=This publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited.| | |
| dc.subject | integriini, kollageeni, αI-domeeni | |
| dc.title | Ihmisen kollageenireseptorin aktivaatio : α1β1- ja α2β1-integriinien αI-domeenin aktivaatiomekanismien rakenne ja toiminta | |
| dc.type.ontasot | fi=Pro gradu -tutkielma|en=Master's thesis| | |
| dc.rights.accessrights | avoin | |
| dc.identifier.urn | URN:NBN:fi-fe2022070150851 | |
| dc.contributor.faculty | fi=Teknillinen tiedekunta|en=Faculty of Technology| | |
| dc.contributor.studysubject | fi=Biokemia|en=Biochemistry| | |
| dc.contributor.department | fi=Bioteknologian laitos|en=Department of Life Technologies| | |
